黄芩提取物作为一种药妆成分，其主要的药理作用如下：
①对多种皮肤致病性真菌，均有抑制作用，并有抗炎、抗变态反应作用。黄芩对多种革兰阳性菌、革兰阴性菌、致病性皮肤真菌有抑制作用，在抗变态反应方面，黄芩甙元较甙作用强。
②吸收紫外线，具抗过敏作用，对于已晒伤的皮肤，有一定修复作用；黄芩是很好的肌肤清道夫，防晒方面，黄芩苷可以吸收紫外线，清除氧自由基，抑制黑色素的生成，让肌肤干净平滑。有研究显示，黄芩苷在相同浓度下抑制痤疮丙酸杆菌的作用是甲硝唑的2倍，是红霉素的115倍。
③具有抗氧化作用：目前研究表明，黄酮类的自由基清除活性与其所含有的酚羟基数量和结构密切相关，其黄芩苷锌和黄芩苷铜对超氧自由基有明显的清除作用，保护皮肤细胞不受氧自由基过度氧化。
④基于黄芩提取物的护肤药理，医学护肤品中常常添加于软膜粉，作面膜用，具有美白、祛斑和除痘的疗肤作用，或按一定的比例添加到美白化妆品、治痤疮产品、抗敏产品及防晒产品中，结合其清除自由基的作用，显示提取物具增加皮肤的新陈代谢、增加皮肤弹性和抗皱的作用，可用于抗衰化妆品；另外，黄芩提取物还可用作抗炎剂、皮脂分泌抑制剂和保湿剂。